平山村に属し、広漠たる原野だったのを、明治九年（一八七六）か十年（一八七七）に京都山科の人、比留多権藤太が土着して開墾に着手し、近村の人々も参加して一部落ができ上った。

　町名は、京都山科から出てきたので、東の山科という意味で東山科と名付けられたと伝えている。土地の人は訛って「やますな」と呼んでいる。