近山から支配を引き継いだ設楽勘左衛門能久（したらかんざえもんよしひさ）は、これまでの八王子系の代官とは異なり、三代将軍徳川家光（とくがわいえみつ）によって取り立てられた勘定所系の役人の家に生まれ、四代家綱（いえつな）・五代綱吉と、勘定として地方諸業務に従事していた。先述の通り、八王子系の代官は綱吉政権期に一斉に粛正されており、かわって、勘定所系の役人が代官となって地域支配に従事するのである。
　設楽の後任の窪島一郎兵衛長敬（くぼしまいちろうべえながのり）は、綱吉が将軍継嗣となる以前の館林藩主（たてばやしはんしゅ）時代、綱吉の江戸屋敷の神田館（かんだやかた）で、勘定系役人として地方業務に従事していた。その後、綱吉の将軍就任にともなって幕臣に編入され、勘定として川除普請（かわよけふしん）に従事し、その後残物奉行（のこりものぶぎょう）・川舟奉行（かわふねぶぎょう）・金奉行（かねぶぎょう）・勘定組頭を歴任したのち代官となっている。
　窪島の後任の清野半右衛門貞平（きよのはんえもんさだひら）は、漆奉行・書替奉行（かきかえぶぎょう）などの勘定所系のポストを歴任したのち代官となる。設楽・窪島・清野の三人が小平市域を支配していた期間は、ちょうど綱吉の治世にあたる。綱吉は村の生活とも密接にかかわる法令を出しているが、これらの触は、代官を通じて村にもたらされた。生類憐れみの令に関連して、市域に残る最も古い触は、元禄五年（一六九二）に設楽が発した鉄砲打禁止等の触書で、以後設楽・窪島・清野は、捨て馬禁止など一連の生類憐れみの令（しょうるいあわれみのれい）を小川村に発している（小川家文書）。
　清野の後任の林甚五右衛門正長（はやしじんごえもんまさなが）は、六代将軍家宣（いえのぶ）が将軍継嗣となる以前の甲府藩主（こうふはんしゅ）時代、家宣の江戸屋敷の桜田館（さくらだやかた）で勘定系の役人を勤めていた。その後、家宣の将軍就任にともなって幕臣に編入され、代官となっている。宝永七年（一七一〇）からは息子の兵右衛門正紹（へいえもんまさつぐ）も、見習いとして小川村の支配に従事している。林の後任の古川武兵衛氏成（ふるかわぶへえうじしげ）は、支配勘定・勘定と、勘定所の実務官僚として昇進し、東北地方の検地などに従事したのち代官となる。古川の後任の堀江半七郎成芳（ほりえはんしちろうなりただ）は、勘定系の家を嗣ぎ、小十人（こじゅうにん）を勤めたのち代官となる。堀江の後任の朝比奈権左衛門資致（あさひなごんざえもんすけよし）はやや経歴が異なり、大番系（おおばんけい）の家に生まれ、納戸番を勤めたのちに代官に転じている。