こうして耕地整理事業の第一歩である測量にとりかかったが、延期派のうちなお整理着工に反対する人びとは、杭打現場におしよせ工事をやめるよう要求して、しばしば混乱をひきおこしたりした。このため警察官の出動も頻繁に行われ逮捕者も出るありさまだった。だが地区内農民のほとんどは、耕地整理を一致して推進して行こうとする気運にあり、のちには工夫となって整理事業をすすめる者もあった。まず施工方法を示すため、技術官の監督指導のもとに各所に模範工事が行われ、用水と排水の分離独立と、反区を長辺三〇間短辺一〇間の一区画一反歩として道路を縦横に直通にするなど、幹線から逐次支線へと工事をすすめていった。また、各部落には集合苗代や共同苗代を選定して稲作の植付に支障のないようにしたり、種籾統一選定をするなど、農業生産力の向上には常に配慮を怠らなかった。

　しかし工事の過程でもいくつかの困難を生じた。明治四十三年九月には大水害が発生し（本章二節参照）、各所の堤塘が決壊したためその復旧工事につとめなければならなかった。また、用水施設整備の一環として、上間久里から大泊に至る須賀堀用水の分流をさらに平方地内まで延長する計画であったが、土地が高く用水に悩む大泊地内から反対があり（越谷市史（五）七五〇頁）設計の一部を変更しなければならなかった。またかねて懸案であった千間堀下流の開さくは増林村の強い反対のため、その実施が遅れていたので、地区内農民から早期完遂の要望が出されたりした。

　さらに、大正四年二月には耕地整理の中心人物の組合長原又右衛門が急死したが、後任には尾崎麟之振が任ぜられ、事業が進められた。かくて大正五年三月すべての工事はここに完了した。

　耕地整理総面積三〇九三町歩、総工費一九万八一三二円、その規模の大きさは当時日本一といわれたが、整理前後の地目別面積は第104表のとおりである。耕地整理の結果、用排水の完備（第105表）と反区の整備がなされたのはもちろんのこと、二毛作田が増大したのは顕著な事績であった。