鎌倉時代を通じて武蔵国衙の実務自体は在庁官人を中心として執行されていた。国守が赴任せず、目代・在庁官人等によって現地の国務が遂行される場合、国衙（こくが）の政庁を留守所（るすどころ）と称する場合があった。武蔵国の場合も中心的政庁を留守所と称した。そして、その留守所を統轄する職が、先に見た武蔵国留守所惣検校職である。この下に留守代・一庁官・二庁官・貫首等の序列化された在庁官人が構成されていたと考えられ、そのもとで書生・国掌等の雑色人が実務を行っていたのであろう。
　また、平安後期頃の国衙には、その職務に応じた分掌機関である「所（ところ）」が恒常的に設置されていた。武蔵国においては、税所・調所・大細工所・内細工所・染殿・糸所・駄所等の所が確認される。税所は国衙領からの田租の徴収を、調所は布・茜等の調の徴収を、大細工所・内細工所は国衙所属の工房であったと考えられる。武蔵国の布は著名な特産品であったが、染殿・糸所はそれらを司る「所」であったと考えられ、府中周辺に残る調布・布田・染地（調布市）、上染屋・下染屋（府中市）等はその関係地名であろう。また、武蔵国は馬の産地としても有名で、多摩郡内には由比牧・小野牧等の牧があった。武蔵国衙内の駄所は馬の生産を司ったとされている。小野牧は大栗川・乞田川水系の奥部の支谷に展開していたと考えられ、その故地は多摩市南西部・八王子市由木地区・日野市七生地区にわたる地域に比定されている（高島一九八八）。特に大栗・乞田両河川の上流域をさす広域地名としてつかわれていた由木（ゆぎ）は、「馬具の鞍橋（くらぼね）の居木（いぎ）のこと」（『日本国語大辞典』）とも考えられ、馬生産ひいては牧の関係地名とされよう。また、狛江市内には駄倉という地名も残されている。

図5―18　武蔵国年貢算用状（資一―635）
国掌・内細工所・大細工所などが見える。称名寺所蔵（金沢文庫管理）

　武蔵国内には、横山権守を名乗る横山氏、太田小権守を名乗る太田氏、久下権守を名乗る久下氏、豊島権守を名乗る豊島氏、庄権守を名乗る庄氏等がいた。これらは、郡司級の豪族でそれぞれ多摩郡（横山氏）・足立郡（太田氏）・大里郡（久下氏）・豊島郡（豊島氏）・児玉郡（庄氏）に拠点を持っており、国衙においても一定の地位を持っていたものと考えられる（峰岸一九八八）。また、郡の下の郷にも郷司職が補任されていた（『吾妻鏡』建暦二年二月十四日条）。