武蔵の守護は建武新政期には足利尊氏が武蔵守とともにこれを兼帯した。その後観応の擾乱前後には高師直・仁木頼章など幕府執事が任じられて幕府の直接支配下に置かれたこともあったが、基本的には関東管領が兼任したようである（杉山一九六六・田辺一九七二）。貞治年間以後は管領山内上杉氏が武蔵守護にあり、管領就任にともなって能憲―憲春―憲方―憲孝と継承された。室町時代になると守護の権限は鎌倉時代よりも大幅に拡大され、使節遵行（しせつじゅんぎょう）や闕所地（けっしょち）処分などの権限を行使して領国支配を進め、段銭や棟別銭など一国に及ぶ課役の賦課・徴収権を掌握して国衙機構を吸収し、一宮など国内寺社にも関与した。使節遵行とは、所領紛争の裁定や所領宛行・寄進などについて、幕府の指令をうけて使節が現地に赴き、指令を執行（遵行）することをいう。この権限を守護が掌握したことで、守護は係争地となった荘園や在地領主にまでも直接介入するようになった。武蔵国内の闕所地処分の権限は鎌倉公方の掌握するところであったとみられるが、その実行は守護によって行なわれ、現地では山内上杉氏の有力被官である長尾氏や大石氏が守護代として守護の命令を執行した。至徳二年（一三八五）武蔵守護であった上杉憲方は、守護代大石遠江守に対して円覚寺造営用途として武蔵一国内に賦課された棟別銭の徴収を命じている（円覚寺文書）。こうした過程を通じて守護は領国の支配を進めていった。
　しかし応永二年（一三九五）上杉朝宗が関東管領に就任し、犬懸上杉氏が武蔵守護職をもつことになった。応永五年（一三九八）鎌倉公方を嗣いだ満兼は幼時より朝宗に育てられ朝宗を重用し、朝宗は応永十二年（一四〇五）に辞職するまで一〇年にわたり管領の職にあった。その間、千坂越後守・長尾兵庫入道（藤景）・埴谷備前入道など犬懸上杉氏の重臣が武蔵守護代として、現地で所領の打渡（うちわた）しや、六所宮造営段銭の免除（資一―709）など守護朝宗の命令を執行している。埴谷備前入道は犬懸上杉氏が守護職をもっていた上総国山武郡の在地武士で、犬懸上杉氏の有力被官である。
　朝宗の関東管領辞任後、その跡には山内上杉憲定が任じられ、応永十八年（一四一一）憲定が病気のため辞任すると、朝宗の子息犬懸上杉氏憲（褝秀）が関東管領に任じられた。武蔵の守護職も山内家と犬懸家が交替でつとめることとなり、それぞれ守護の職権をもって在地の武士等の掌握につとめたものと思われる。国内の在地領主等は、守護の被官となり、あるいは奉公衆として公方と結び付き、あるいは近隣の領主と一揆を結んで上部権力に対して自立性を確保し、所領の保全をはかっていった。応永二十四年（一四一七）上杉禅秀の乱後は山内上杉氏が武蔵守護となり上杉憲基・憲実のもとで、長尾芳伝・大石遠江入道道守・憲重が守護代をつとめ、守護の諸権限を駆使しての国人層の組織化が進められていった。