区内には国立大学として、東京水産大学（港区港南4―5―7）がある。昭和45年（1970）以降、施設・設備の拡充をはかるとともに、学部の学科改編を行い、教授内容の一新をはかっている。東京水産大学は水産の単科大学で次の7学科から成りたっている。
　
　水産学部　　漁業生産学科　漁業生産工学科　食品生産学科　食品生産工学科
　　　　　　　資源増殖学科　水産養殖学科　海洋環境工学科
　なお、このほか大学院水産学研究科、水産教員養成課程（各学科から2名ずつ履修させる。）専攻科が設置されている。