港区内の私立小・中学校、高等学校は平成期に新設・廃止はされていない。一方で、既存の学校での改革が多く見られる。特に一貫教育への転換を図る私立学校が多く、12年間を学校独自のステージに分ける小中高一貫教育や、高校からの入学者募集をなくして事実上中学校からの入学者に対して6年間の一貫したカリキュラムで教育をする中高一貫教育への転換などが行われている。