地区教育会議は会場確保、テーマ設定、参加者公募などについて、各総合支所との協働により実施している。テーマなどの決定には各総合支所特有の課題もあるため、あらかじめ教育委員会と総合支所が調整・連携して進めている。参加者は、公募区民、教育長、教育委員、教育委員会事務局幹部職員、校長、園長、総合支所長、協働推進課長である。
　各年度のテーマは以下の通りである。平成30年度を除き、いずれも芝、麻布、赤坂、高輪、芝浦港南の各地区で実施された。
　平成21年度「学校・教育委員会と地域との連携について」
　平成22年度「子どもの健全な成育環境の向上について」
　平成23年度「東日本大震災を踏まえた子どもの安全・安心の確保について」
　平成24年度「小中一貫教育について」
　平成25年度「地域資源を活用した地域と学校との連携について」
　平成26年度「地域の特性を生かした教育のあり方について」
　平成27年度「地域で子どもたちが健やかに育つために～地域における青少年の健全育成について～」
　平成28年度「学校・家庭・地域の連携による子どもの未来応援～子どもたちへの教育支援について～」
　平成29年度「地域で支える学校運営～教員が子どもと向き合う時間の充実に向けて～」
　平成30年度「地域とともにある学校づくりへの転換～学校運営協議会制度（コミュニティ・スクール）の導入に向けて～」（赤坂、芝浦港南の2地区で実施）