相談員は、指導主事、教育相談事業担当者、他の教育相談員、つばさ教室および電話教育相談担当者らと、相互に連携・連絡・調整を図りながら相談者に対する支援を行っている。さらに、小・中学校スクールカウンセラー、東京都教育相談センターなど他の相談所、医療機関との連携を確立し、相談事業のより一層の充実を目指している。