基本計画策定時の地域懇談会が契機となり、平成一八年六月以降、芝・麻布・赤坂・高輪・芝浦港南の各地区で、地域のことを考え、地域の課題を自ら解決し、地域の魅力を高めようとする区民参画組織が発足した。各地区の参画組織の名称は次のとおりである。
芝地区総合支所……「芝会議」
麻布地区総合支所……「麻布を語る会」
赤坂地区総合支所……「赤坂・青山地区タウンミーティング」
高輪地区総合支所……「タウンミーティングTAKANAWA」
芝浦港南地区総合支所……「港区ベイエリア・パワーアッププロジェクト」
区民参画組織は、事業者や教育機関、町会・自治会連合組織などと連携し、まちの清掃活動など、様々な協働事業に取り組んだ。