C区は、三重塔の西側と南側に設定したトレンチである。調査の目的は、奈良時代の創建時の塔が、本来どの位置にあったのかを探ることであった。
　検出された遺構は、南側トレンチのわずかなピットだけで、遺物も現在の三重塔に関係する明治期以降のものばかりであり、奈良・平安時代の遺物はまったく出土しなかった。