承久三年（一二二一）、三代将軍実朝の死を幕府打倒の好機とみた後鳥羽上皇は、北条義時追討の兵を挙げました。鎌倉幕府は、直ちに、総計十九万騎を編成し京へ向かいます。この「承久の乱」の経過を記した『承久記』によると、宇治川の渡河作戦で相馬三郎・太郎・次郎の三人が戦死しています。『寛政譜』によれば、五郎義胤の戦功とありますが、信じ難く三郎は庶子家の兄で、太郎・次郎はその子等ではないかと思われます。
相馬師常のやぐら墓（鎌倉市扇ケ谷）
宇治川の古戦場（宇治市宇治）
乱後、幕府は後鳥羽上皇を配流し、京に六波羅探題を設置し、多くの御家人を近畿・西国に派遣しました。義胤も越後守護代に就いたらしく、元仁二年（一二二五）二月の「関東下知状写」／『後藤文書』に、「前守護代相馬五郎」とあります。
また、貞応二年（一二二三）四月の「淡路国太田文（おおたぶみ）」／『皆川文書』に「新地頭相馬小次郎」とありますが、小次郎の実名（じつみょう）（諱（いみな））は不詳。
嘉禄三年（一二二七）十二月、義胤は娘の土用（とよ）御前に対し、所領の一部を譲ります（「相馬能胤（よしたね）譲状案」／『新田岩松文書』。土用御前は、父から譲られた福島県相馬郡飯舘（いいたて）村草野および柏市手賀・布瀬・藤心・そして守谷市の野木崎の所領を持参して、岩松時兼に嫁ぎました。
安貞二年（一二二八）七月、将軍頼経（よりつね）の三浦義村邸渡御に、相馬五郎（義胤）が供奉しています（『吾妻鏡』）。