保科村は元和(げんな)八年（一六二二）真田信之が松代に入封して以来、明治二年（一八六九）の廃藩置県まで二五〇年間松代領であった。松代領では、蔵入地（藩の直轄地(ちょっかつち)）と藩士の知行地の混在している村が多かったが、保科村は蔵人地のみであった。藩行政区は「河東通(かわひがしどおり)」に属した。