①（岩盤などを）貫いて水（井）が湧き出ていたため。
②「山抜け（＝ヌケ）」（地すべり、がけ崩れ）により水が湧き出ていたため。
③温かい水が湧いていたことから「温井（ぬくい）」と呼ばれ、その表記が変化したもの（※冬場は出頭付近で「湯気が立っていた」との証言あり）。
※同様の地名＝都下の小金井市貫井北町・貫井南町など。
※「石神井」「貫井」など、「井」の地名が付く地は、基本的に湧水が豊富、「良い水が湧く場所」。
※「貫井池」の名は江戸期絵図にはなく、呼称は「溜井」。明治～大正期からの呼び名と思われる（「貫井の池」から次第に「貫井池」に変わったか？）。