一方、天正一九年（一五九一）八月には、侍・奉公人が町人や百姓になったり、百姓が田畠を捨てて商売や賃仕事に出ることを禁止した。それはすなわち士・農・商を分離する身分統制令である。
　こうして、検地によって田畠の耕作者たる百姓を確定し、その武器を剥奪（はくだつ）して、武士身分と明確に区分する兵農分離の政策が、ぐんぐんと押し進められていったのである。