どこの荘園にも鎮守(ちんじゅ)がまつられている。荘園の管理人から農民まですべての人は荘民として、鎮守の神に崇敬をささげる。氏神(うじがみ)を信仰するのは武士である(惣領制の条参照)。有力農民は、自分の屋敷うちに神をまつるばあいもあるし、小さな神社を崇拝したこともある。