箱館裁判所は、直ぐに箱館府と改称(慶応4年閏4月21日の「政体書」を受けて3日後の24日改称…蝦夷地での布達は7月17日)された後、開拓使が設置されるまで蝦夷地の諸政を担当したわけであるが、新政府が誕生したばかりで、諸制度が未整備であったため、これまでその設置時期や改廃に関して混乱がみられる。